很多人认为，自闭症患者的主要问题是难以对信息进行整体加工提取，并基于此提出了WCC模型理论。WCC理论认为，个体对信息进行加工时，对于意义是进行整体性提取的，而自闭症患者只能从局部意义进行提取，也就是说，患者的信息加工是碎片化的，难以将片段式的信息整合成有意义的整体。所以说，与正常儿童相比，自闭症儿童很难很好地利用背景环境来为自己做参照。该理论不同于心理理论等，它揭示了自闭症患者行为等方面的异常。

很多人结合fMRI技术研究发现，自闭症患者位于前额叶皮层的镜像神经元活动明显弱于正常人，也就是说，自闭症患者的镜像神经元系统可能工作失常。采用EEG进行的研究也发现镜像神经元存在异常，当正常人在自己做动作或观察别人的动作时，其椎体神经元同步活动的电信号之后会在感觉运动皮层出现一个后续的抑制作用过程，而自闭症患者在完成相同任务的过程中，并没有出现类似的抑制过程。镜像神经元是当一个人在模仿他人时脑部特定的激活部位，这一区域神经活动的减弱在某种意义上说明了自闭症患者行为背后脑结构上的异常。

总的来说，自闭症患者存在社会交往能力缺乏和刻板行为，存在着脑结构与功能的异常，以往的研究虽已经取得了一些成果，但是还没有达到一致的稳定的结论。对患者存在的脑区发育异常，以及不同脑区之间的结构和功能神经通路还需要进一步阐释，这将有助于人们更好地理解自闭症的病理生理学机制。截至目前，基于认知神经科学技术(磁共振、脑电波等)的研究越来越多，而一致性的结论还相对较少，未来的研究需要大样本的纵向追踪研究来进一步寻找自闭症的神经生物学标记，为预防、诊断和干预自闭症患者提供更为..的依据。